要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biosigner”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
![]() ![]() |
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见biosigner.
Bioconductor版本:3.4
特征选择在组学数据分析中至关重要,可以从复杂的高维数据中提取受限的、有意义的分子特征,并构建健壮的分类器。这个包实现了一种新的方法来评估变量与分类器预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA、随机森林和SVM二元分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型,从而实现对新数据集的未来预测。在Workflow4metabolomics.org的计算代谢组学在线基础设施中可以获得该包的Galaxy实现。
作者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>, Etienne Thevenot < Etienne。Thevenot at cea.fr>
维护者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>, Etienne Thevenot < Etienne。Thevenot at cea.fr>
引文(从R内,输入引用(“biosigner”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biosigner”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biosigner”)
R脚本 | 装饰图案的标题 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,FeatureExtraction,Lipidomics,代谢组学,蛋白质组学,软件,转录组 |
版本 | 1.2.4 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(1年) |
许可证 | CeCILL |
取决于 | |
进口 | 方法,e1071,randomForest,ropls,Biobase |
链接 | |
建议 | BioMark,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,golubEsets,hu6800.db,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | biosigner_1.2.4.tar.gz |
Windows二进制 | biosigner_1.2.4.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | biosigner_1.2.4.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/biosigner/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biosigner/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |