要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biosigner”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

biosigner

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见biosigner

从组学数据中发现特征

Bioconductor版本:3.4

特征选择在组学数据分析中至关重要,可以从复杂的高维数据中提取受限的、有意义的分子特征,并构建健壮的分类器。这个包实现了一种新的方法来评估变量与分类器预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA、随机森林和SVM二元分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型,从而实现对新数据集的未来预测。在Workflow4metabolomics.org的计算代谢组学在线基础设施中可以获得该包的Galaxy实现。

作者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>, Etienne Thevenot < Etienne。Thevenot at cea.fr>

维护者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>, Etienne Thevenot < Etienne。Thevenot at cea.fr>

引文(从R内,输入引用(“biosigner”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biosigner”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“biosigner”)

PDF R脚本 装饰图案的标题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类FeatureExtractionLipidomics代谢组学蛋白质组学软件转录组
版本 1.2.4
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证 CeCILL
取决于
进口 方法,e1071randomForestroplsBiobase
链接
建议 BioMarkRUnitBiocGenericsBiocStylegolubEsetshu6800.dbknitrrmarkdown
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 biosigner_1.2.4.tar.gz
Windows二进制 biosigner_1.2.4.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) biosigner_1.2.4.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/biosigner/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biosigner/
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