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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅bioCancer。

交互式Multi-Omics癌症数据可视化和分析

Bioconductor版本:3.4

bioCancer是一个闪亮的应用可视化和分析交互式Multi-Assays癌症基因组数据。

作者:卡里姆Mezhoud (aut (cre)

维护人员:卡里姆Mezhoud < kmezhoud gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	bioCancer:互动Multi-OMICS癌症数据可视化和分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation,GUI,GeneExpression,GeneTarget,MultipleComparison,网络,通路,Reactome,软件,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证	AGPL-3 |文件许可
取决于	magrittr(> = 1.5),ggplot2(> = 1.0.0),lubridate(> = 1.3.3),tidyr(> = 0.3.1),cgdsr,RCurl,XML
进口	dplyr(> = 0.4.3),htmlwidgets,Biobase,geNetClassifier,AnnotationFuncs,org.Hs.eg.db,剂量,clusterProfiler,reactome.db,ReactomePA,plyr,统计grDevices跑龙套,图(> = 0.7),visNetwork,车,质量(> = 7.3),gridExtra(> = 2.0.0),AlgDesign(> = 1.1.7.3),心理(> = 1.4.8.11),GPArotation(> = 2014.11.1),wordcloud(> = 2.5),减价(> = 0.7.4),knitr(> = 1.8),ggdendro(> = 0.1.17),扫帚(> = 0.3.7),pryr(> = 0.1),闪亮的(> = 0.13.2),jsonlite(> = 0.9.17),shinyAce(> = 0.1),DT(> = 0.1),readr(> = 0.1.1),data.tree(> = 0.2.1),yaml(> = 2.1.13),尺度(> = 0.2.5),旋度(> = 0.9.1),covr(> = 1.2.0),stringr(> = 1.0),宠物猫
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown,testthat(> = 0.10.0)
SystemRequirements
增强了
URL	http://kmezhoud.github.io/bioCancer
BugReports	https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	bioCancer_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	bioCancer_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	bioCancer_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/biocancer/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bioCancer/
包下载报告	下载数据