##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("bamsignals")

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本，请参见bamsignals．

从bam文件中提取读取计数信号

Bioconductor版本:3.4

这个包允许有效地从有索引的bam文件中获取计数向量。它计算给定基因组范围内的读取次数，并计算读取概要和覆盖概要。它还处理成对的端数据。

作者:Alessandro Mammana [aut, cre]， Johannes Helmuth [aut]

维护者:Alessandro Mammana < Mammana at molgen.mpg.de>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("bamsignals")

文档

超文本标记语言	R脚本	bamsignals包的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，报道，DataImport，测序，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor公司	BioC 3.1 (R-3.2)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.2.0)
进口	方法,BiocGenerics，Rcpp(> = 0.10.6),IRanges，GenomicRanges，zlibbioc
链接	Rcpp，Rhtslib，zlibbioc
建议	testthat(> = 0.9),Rsamtools，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	AneuFinder，chromstaR，normr
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	bamsignals_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	bamsignals_1.6.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.9(小牛队)	bamsignals_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/bamsignals/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bamsignals/
软件包下载报告	下载数据