要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见arrayQualityMetrics.
Bioconductor版本:3.4
这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。支持一种和两种颜色阵列平台。
作者:奥黛丽·考夫曼,沃尔夫冈·胡贝尔
维护者:Audrey Kauffmann
引用(从R中,输入引用(“arrayQualityMetrics”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http:// if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("arrayQualityMetrics")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)
R脚本 | 高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理 | |
R脚本 | 简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,ReportWriting,软件,TwoChannel |
版本 | 3.30.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.1 (R-2.6)(9.5年) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | affy,affyPLM(> = 1.27.3),beadarray,Biobase,开罗(> = 1.4 6),genefilter、图形、grDevices、网格、gridSVG(> = 1.4 3),Hmisc,hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、RColorBrewer,setRNG, SVGAnnotation (>= 0.9-0),vsn(> = 3.23.3),XML |
链接 | |
建议 | ALLMLL,亚兰,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 天哪 |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | arrayQualityMetrics_3.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | arrayQualityMetrics_3.30.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛队) | arrayQualityMetrics_3.30.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/arrayQualityMetrics/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/ |
包下载报告 | 下载数据 |