要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ affyplm”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

affyplm

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅affyplm

拟合探针级模型的方法

生物导体版本:3.4

扩展并改善基本象征包的功能的软件包。大量使用编译代码的例程。中心重点是实施使用这些模型拟合探针级模型和工具的方法。基于PLM的质量评估工具。

作者:Ben Bolstad

维护者:Ben Bolstad

引用(从r内,输入引用(“ affyplm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ affyplm”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ affyplm”)

PDF R脚本 Affyplm:Maplot功能的高级使用
PDF R脚本 affyplm:拟合探针级别模型
PDF R脚本 Affyplm:基于模型的Affymetrix Genechips评估
PDF R脚本 affyplm:threestep功能
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 12年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.6.0),生物基因(> = 0.3.2),副词(> = 1.11.0),生物酶(> = 2.17.8),GCRMA,统计预处理(> = 1.5.1)
进口 Zlibbioc,图形,grdevices,方法
链接 预处理
建议 Affydata,,,,大量的
系统要求
增强
URL https://github.com/bmbolstad/affyplm
取决于我 refplus
进口我 affylmgui,,,,Affyqcreport,,,,ArrayQualityMetrics
建议我 AffyExpress,,,,arraymvout,,,,Arraytools,,,,生物探测,,,,生物基因,,,,弯头,,,,Frmatools,,,,metahdep,,,,Onechannelgui,,,,钢琴
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 affyplm_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 affyplm_1.50.0.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.9(Mavericks) affyplm_1.50.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/affyplm/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/affyplm/
软件包下载报告 下载统计

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