要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ affyplm”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅affyplm。
生物导体版本:3.4
扩展并改善基本象征包的功能的软件包。大量使用编译代码的例程。中心重点是实施使用这些模型拟合探针级模型和工具的方法。基于PLM的质量评估工具。
作者:Ben Bolstad
维护者:Ben Bolstad
引用(从r内,输入引用(“ affyplm”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ affyplm”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ affyplm”)
R脚本 | Affyplm:Maplot功能的高级使用 | |
R脚本 | affyplm:拟合探针级别模型 | |
R脚本 | Affyplm:基于模型的Affymetrix Genechips评估 | |
R脚本 | affyplm:threestep功能 | |
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件 |
版本 | 1.50.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 12年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.6.0),生物基因(> = 0.3.2),副词(> = 1.11.0),生物酶(> = 2.17.8),GCRMA,统计预处理(> = 1.5.1) |
进口 | Zlibbioc,图形,grdevices,方法 |
链接 | 预处理 |
建议 | Affydata,,,,大量的 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/bmbolstad/affyplm |
取决于我 | refplus |
进口我 | affylmgui,,,,Affyqcreport,,,,ArrayQualityMetrics |
建议我 | AffyExpress,,,,arraymvout,,,,Arraytools,,,,生物探测,,,,生物基因,,,,弯头,,,,Frmatools,,,,metahdep,,,,Onechannelgui,,,,钢琴 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | affyplm_1.50.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyplm_1.50.0.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | affyplm_1.50.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/affyplm/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/affyplm/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |