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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见YAPSA．

又一个用于签名分析的软件包

Bioconductor版本:3.4

该软件包提供了在体细胞特征分析中有用的函数和例程(参见L. Alexandrov等人，Nature 2013)。特别地，提供了对已知签名进行签名分析(LCD =线性组合分解)和对分层突变目录进行签名分析(SMC =分层突变目录)的函数。

作者:Daniel Huebschmann，顾祖光，Matthias Schlesner

维护者:Daniel Huebschmann < Huebschmann。Daniel在googlemail.com>上报道

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

超文本标记语言	R脚本	YAPSA
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion，聚类，DNASeq，GenomicVariation，测序，软件，SomaticMutation，StatisticalMethod，可视化
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3.0)，GenomicRanges，ggplot2、网格
进口	lsei，SomaticSignatures，VariantAnnotation，GenomeInfoDb，reshape2，gridExtra，corrplot，dendextend，GetoptLong，circlize，gtrellis，PMCMR，ComplexHeatmap，KEGGREST, grDevices
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
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全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	YAPSA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	YAPSA_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	YAPSA_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/YAPSA/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/YAPSA/
软件包下载报告	下载数据