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变体工具

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅变体工具

使用遗传变异的工具

生物导体版本:3.4

用于检测,过滤,调用,比较和绘制变体的工具。

作者:迈克尔·劳伦斯(Michael Lawrence)

维护者:迈克尔·劳伦斯(Michael Lawrence)

引用(从r内,输入引用(“ varianttools”)):

安装

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文档

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browsevignettes(“ varianttools”)

PDF R脚本 Varianttools简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传因素,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges(> = 1.99.2),基因组机(> = 1.17.7),变体(> = 1.11.16),方法
进口 rsamtools(> = 1.17.6),生物基因,,,,生物弦, 平行,GMAPR(> = 1.13.4),GenomicFeatures(> = 1.17.13),矩阵,,,,rtracklayer(> = 1.25.3),生物比较,,,,GenomeInfodB,,,,BSGENOME,,,,生物酶
链接
建议 运行,,,,肺部(> = 0.0.6),rbgl,,,,图形
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 htseqgenie
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 varianttools_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/varianttools/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/varianttools/
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