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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅变体。

遗传变异的注释

生物导体版本：3.4

注释变体，计算氨基酸编码变化，预测编码结果。

作者：Valerie Obenchain [AUT，CRE]，Martin Morgan [AUT]，Michael Lawrence [AUT]，Stephanie Gogarten [CTB]

维护者：valerie obenchain 的维护者>

安装

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文档

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browsevignettes（“变体”）

PDF	R脚本	FilterVCF概述
PDF	R脚本	变体介绍
PDF		参考手册
文本		消息
视频		读取VCF数据

细节

生物浏览	注解，，，，DataImport，，，，遗传学，，，，SNP，，，，测序，，，，软件，，，，变体
版本	1.20.3
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（5。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.8.0），方法，生物基因（> = 0.15.3），GenomeInfodB（> = 1.7.1），基因组机（> = 1.19.47），总结性特征（> = 0.3.1），rsamtools（> = 1.23.10）
进口	utils，DBI，，，，Zlibbioc，，，，生物酶，，，，S4VECTORS（> = 0.9.47），iranges（> = 2.3.25），xvector（> = 0.5.6），生物弦（> = 2.33.5），AnnotationDbi（> = 1.27.9），BSGENOME（> = 1.37.6），rtracklayer（> = 1.25.16），GenomicFeatures（> = 1.19.17）
链接	S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦，，，，rsamtools
建议	运行，，，，AnnotationHub，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109，，，，sift.hsapiens.dbsnp132，，，，sift.hsapiens.dbsnp137，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，snpstats，，，，GGPLOT2，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我	ampliqueso，，，，CGDV17，，，，CNVRD2，，，，Deepsnv，，，，doqtl，，，，ememblvep，，，，Genotypeeval，，，，GoogleGenomics，，，，Helloranges，，，，htseqgenie，，，，myvariant，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，属属，，，，R453plus1toolbox，，，，Rarevariantvis，，，，稀有，，，，sift.hsapiens.dbsnp132，，，，sift.hsapiens.dbsnp137，，，，躯体签名，，，，变体滤波器，，，，变体工具
进口我	等位基因平衡，，，，不良区域，，，，BBCANALYZER，，，，Biovizbase，，，，宇宙67，，，，CustomProdb，，，，funcisnp，，，，GenBankr，，，，Genomicfiles，，，，GGBIO，，，，ggtools，，，，GMAPR，，，，gqtlstats，，，，Gwascat，，，，Madseq，，，，mafdb.esp6500si.v2.ssa137，，，，maftools，，，，甲基分析，，，，Motifbreakr，，，，突变模式，，，，PGA，，，，Seqarray，，，，Seqvartools，，，，签名者，，，，Snphood，，，，Systempiper，，，，TVTB，，，，yapsa
建议我	AnnotationHub，，，，Ashkenazimsonchr21，，，，crisprvariants，，，，基因组机，，，，geuvadistranscriptexpr，，，，GMRP，，，，Gwastools，，，，podkat，，，，TrackViewer，，，，三人组，，，，vtpnet
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	variantAnnotation_1.20.3.tar.gz
Windows二进制	variantantation_1.20.3.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.9（Mavericks）	variantantation_1.20.3.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/variantannotation/tree/release-3.4
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/variantannotation/
软件包下载报告	下载统计