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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TitanCNA。

Subclonal拷贝数和LOH预测肿瘤的全基因组测序

Bioconductor版本:3.4

隐马尔科夫模型部分和预测区域subclonal拷贝数改变(CNA)和杂合性丢失(LOH),并估计在肿瘤细胞克隆集群的prevalenece全基因组测序数据。

作者:加文·哈,索拉博P沙

维护者:索拉博加文•哈< gavinha broadinstitute.org > P沙< sshah在bccrc.ca >

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PDF	R脚本	TitanCNA
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DNASeq,ExomeSeq,遗传学,GenomicVariation,HiddenMarkovModel,测序,软件,StatisticalMethod,WholeGenome
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.2.0),foreach(> = 1.4.2),IRanges(> = 2.2.4)GenomicRanges(> = 1.20.5),Rsamtools(> = 1.20.4),GenomeInfoDb(> = 1.4.0)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/gavinha/TitanCNA
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	TitanCNA_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	TitanCNA_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9(小牛)	TitanCNA_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/titancna/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TitanCNA/
包下载报告	下载数据