安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“TarSeqQC”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TarSeqQC。
Bioconductor版本:3.4
包允许表示r .这是基于目前的有针对性的实验方案和合并功能做一个质量控制这类实验和测序的快速勘探地区。生成一个xlsx文件作为输出。
作者:加芙美利奴,克里斯托瓦尔弗雷斯诺,Yanina Murua,安德里亚Llera和埃尔默费尔南德斯
维护人员:加芙美利奴< gmerino在bdmg.com.ar >
从内部引用(R,回车引用(“TarSeqQC”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“TarSeqQC”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TarSeqQC”)
R脚本 | TarSeqQC:有针对性的测序实验质量控制 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,报道,DataImport,质量控制,测序,软件,TargetedResequencing,可视化 |
版本 | 1.4.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(1.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(> = 3.2.1)、方法GenomicRanges,Rsamtools(> = 1.20.4),ggplot2,plyr,openxlsx |
进口 | 统计,grDevices跑龙套,S4Vectors,IRanges,BiocGenerics,reshape2,GenomeInfoDb,BiocParallel,Biostrings,cowplot、图形、GenomicAlignments,Hmisc |
链接 | |
建议 | RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.ar |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | TarSeqQC_1.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | TarSeqQC_1.4.1.zip |
Mac OS X 10.9(小牛) | TarSeqQC_1.4.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/tarseqqc/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TarSeqQC/ |
包下载报告 | 下载数据 |