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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SummarizedExperiment。

SummarizedExperiment容器

Bioconductor版本:3.4

SummarizedExperiment容器包含一个或多个化验,每个代表一个矩阵像对象的数字或其他模式。行通常代表基因组范围的利益和列代表样本。

作者:马丁·摩根,吉姆·海丝特瓦莱丽•Obenchain Herve页面

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	SummarizedExperiment
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,报道,遗传学,GenomeAnnotation,基础设施,测序,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.2),方法,GenomicRanges(> = 1.23.15),Biobase
进口	跑龙套,统计数据,矩阵,BiocGenerics(> = 0.15.3),S4Vectors(> = 0.11.7),IRanges(> = 2.7.2),GenomeInfoDb
链接
建议	注释,AnnotationDbi,hgu95av2.db,GenomicFeatures,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,BiocStyle,knitr,rmarkdown,消化,jsonlite,rhdf5,气道,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	气道,AllelicImbalance,anamiR,BiSeq,bsseq,clusterExperiment,csaw,deepSNV,DESeq2,DEXSeq,DiffBind,diffHic,DREAM4,dsQTL,epigenomix,ExpressionAtlas,裂变,GenoGAM,GenomicAlignments,GenomicFiles,genoset,geuvPack,GRmetrics,HelloRanges,InteractionSet,isomiRs,JunctionSeq,桅杆,工商管理硕士,methylPipe,minfi,parathyroidSE,重新计票,RIPSeeker,scRNAseq,SGSeq,simulatorZ,soGGi,VanillaICE,VariantAnnotation,山药,yriMulti
进口我	ALDEx2,高山,anamiR,BBCAnalyzer,biovizBase,BiSeq,ChIPpeakAnno,CNPBayes,COSMIC.67,DChIPRep,debrowser,反编排,easyRNASeq,EnrichmentBrowser,ensemblVEP,epivizrData,erma,FourCSeq,GGBase,ggbio,gQTLBase,gQTLstats,GreyListChIP,gwascat,HTSeqGenie,IHWpaper,M3D,MADSEQ,methyAnalysis,methylumi,MinimumDistance,MoonlightR,MultiAssayExperiment,MultiDataSet,MutationalPatterns,oligoClasses,pcaExplorer,PureCN,R453Plus1Toolbox,readat,regionReport,regsplice,rgsepd,咆哮,SeqArray,SNPchip,SNPhood,SVAPLSseq,systemPipeR,TCGAbiolinks,ToPASeq,TVTB,VariantFiltering
建议我	AnnotationHub,biobroom,epivizr,esetVis,GenomicRanges,globalSeq,HDF5Array,interactiveDisplay,podkat,RiboProfiling
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	SummarizedExperiment_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	SummarizedExperiment_1.4.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	SummarizedExperiment_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/summarizedexperiment/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SummarizedExperiment/
包下载报告	下载数据