##尝试http：//如果不支持https：// urls源（“https://biocondudard.org/bioclite.r”）Bioclite（“SplicingGraphs”）

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本，请参阅拼接照片。

创建，操纵，可视化拼接图，并将RNA-SEQ读取给它们

Bioconductor版本：3.4

该包允许用户根据给定生物体的基因模型来创建，操纵和可视化拼接图和它们的气泡。此外，它允许用户将RNA-SEQ读取到一组拼接图的边缘，并以不同的方式汇总它们。

作者：D. Bindreit，M. Carlson，M. Morgan，H.Pagès

维护者：H.Pagès

安装

要安装此包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// urls源（“https://biocondudard.org/bioclite.r”）Bioclite（“SplicingGraphs”）

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“拼接图”）

PDF.	r script.	拼接图和RNA-SEQ数据
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	替代品那注解那datarepresentation.那基因表达那遗传学那rnaseq.那测序那软件那转录那可视化
版本	1.14.0.
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（4年）
执照	艺术-2.0
依靠	基因组法（> = 1.17.13），基因管理（> = 1.1.22），rghrachviz（> = 2.3.7）
进口	方法，Utils，图形，iGraph.那生物根系那S4Vectors.（> = 0.9.25），绞喉（> = 2.3.21），genomeinfodb.那Genomicranges.（> = 1.23.21），基因组法那RSAMTOOLS.那基因管理那图形那rghrachviz
链接到
建议	iGraph.那GVIZ.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14.那运行
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	SplicingGraphs_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件	SplicingGraphs_1.14.0.zip.
Mac OS x 10.9（mavericks）	SplicingGraphs_1.14.0.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/splicinggraphs/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/splicinggraphs/
包裹下载报告	下载统计信息