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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅蜘蛛网。

蜘蛛网：用于综合网络分析的R/生物通用套件与miRNA数据

生物导体版本：3.4

Spidermir的目的是：i）促进网络从GeneMania数据中从GeneMania数据中检索网络，ii）使用适当的基因命名法制备数据，iii）在特定网络中将miRNA数据整合到特定网络中，iv）提供不同的标准分析和V）允许用户可视化结果。更详细地，该软件包提供了多种查询，准备和下载网络数据（GenMania）以及与经过验证和预测的miRNA数据集成（Mirwalk，Mir2Disease，Mirtar，Mirtar，Mirandola，Pharmaco-Mir，Diana，Miranda，Miranda，Pictar，Pictar和Targetscan））以及标准分析（IGRAPH）和可视化方法（NetworkD3）的使用。

作者：Claudia Cava，Antonio Colaprico，Alex Graudenzi，Gloria Bertoli，Tiago C. C. C. Silva，Catharina Olsen，Houtan Noushmehr，Gianluca Bontempi，Giancarlo Mauri，Isabella Castiglioniiii castiglioniii

维护者：claudia cava

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

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Browsevignettes（“蜘蛛网”）

PDF	R脚本	蜘蛛网示例
html	R脚本	使用蜘蛛包装
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结肠管制，，，，网络，，，，软件，，，，mirna
版本	1.4.8
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（1年）
执照	GPL（> = 3）
要看	R（> = 3.0.0）
进口	NetworkD3，，，，httr，，，，Igraph，utils，统计，mirnatap，，，，mirnatap.db，，，，AnnotationDbi，，，，org.hs.eg.db，，，，GGPLOT2，，，，栅格，，，，GPLOTS，grdevices，格子，，，，LatticeExtra，，，，Visnetwork，，，，tcgabiolinks
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，DevTools，，，，roxygen2
系统要求
增强
URL	https://github.com/claudiacava/spidermir
BugReports	https://github.com/claudiacava/spidermir/issues
取决于我
进口我	Starbiotrek
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	spidermir_1.4.8.tar.gz
Windows二进制	spidermir_1.4.8.zip
Mac OS X 10.9（Mavericks）	spidermir_1.4.8.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/spidermir/tree/release-3.4
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/spidermir/
软件包下载报告	下载统计