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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见SigCheck．

对照随机特征、已知特征和排列数据/元数据，检查基因特征的预后性能

Bioconductor版本:3.4

虽然基因签名经常被用于预测表型(例如预测癌症患者的预后)，但并不总是清楚它们有多理想或有意义(参见David Venet, Jacques E. Dumont和Vincent Detours的论文“大多数随机基因表达签名与乳腺癌结局显著相关”)。根据该论文中的建议，SigCheck接受一个数据集(作为一个ExpressionSet)和一个基因签名，并将其在生存和/或分类任务中的表现与a)相同长度的随机基因签名进行比较;B)已知的、相关的和不相关的基因特征;c)打乱的数据和/或元数据。

作者:Rory Stark < Rory。Stark在cruk.cam.ac.uk>而且Justin Norden

维护者:Rory Stark < Rory。Stark在cruk.cam.ac.uk>

安装

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文档

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browseVignettes(“SigCheck”)

PDF	R脚本	用SigCheck检查随机和已知的基因表达签名
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，GeneExpression，GeneSetEnrichment，软件
版本	2.6.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.2.0)，MLInterfaces，Biobase，e1071，BiocParallel，生存
进口	图形，统计，utils，方法
链接
建议	BiocStyle，breastCancerNKI，qusage
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	SigCheck_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	SigCheck_2.6.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	SigCheck_2.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/SigCheck/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SigCheck/
软件包下载报告	下载数据