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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SeqVarTools。

工具变量数据

Bioconductor版本:3.4

一个接口的快速访问存储格式VCF SeqArray提供的数据,与常见的操作和分析的工具。

作者:斯蒂芬妮·m·Gogarten Xiuwen郑,艾德丽安Stilp

维护人员:斯蒂芬妮·m·Gogarten < sdmorris u.washington.edu >, Xiuwen郑< zhengx u.washington.edu >,艾德丽安Stilp < amstilp u.washington.edu >

安装

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文档

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browseVignettes (“SeqVarTools”)

PDF	R脚本	介绍SeqVarTools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,测序,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	SeqArray(> = 1.11.17)
进口	grDevices、图形、数据、方法、stringr,gdsfmt,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,GWASExactHW,VariantAnnotation,Biobase,logistf
链接
建议	BiocGenerics,BiocStyle,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	《创世纪》
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	SeqVarTools_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	SeqVarTools_1.12.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	SeqVarTools_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/seqvartools/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/
包下载报告	下载数据