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此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见SeqArray。

全基因组序列变异调用的大数据管理

Bioconductor版本:3.4

千千万万个体的全基因组测序变体调用的大数据管理:SeqArray文件中的基因型数据(如SNVs、indels和结构变体调用)和注释以面向数组和压缩的方式存储，使用R编程语言进行高效的数据访问。

作者:郑秀文[aut, cre]， Stephanie Gogarten [aut]， David Levine [ctb]， Cathy Laurie [ctb]

维护者:郑秀文<郑x在u.washington.edu>

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqArray”)

文档

超文本标记语言	R脚本	R集成
超文本标记语言	R脚本	SeqArray数据格式和访问
超文本标记语言		SeqArray概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,遗传学,基础设施,测序,软件
版本	1.14.1
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3.0),gdsfmt(> = 1.10.1)
进口	方法、并行S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,GenomeInfoDb,SummarizedExperiment,Biostrings,VariantAnnotation
链接	gdsfmt
建议	BiocParallel,消化,蜡笔,RUnit,Biobase,BiocGenerics,knitr,Rcpp,SNPRelate
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/zhengxwen/SeqArray
BugReports	http://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues
取决于我	SeqVarTools
进口我	《创世纪》
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	SeqArray_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	SeqArray_1.14.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	SeqArray_1.14.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/SeqArray/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SeqArray/
包下载报告	下载数据