要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SVAPLSseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SVAPLSseq

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见SVAPLSseq

svaplsseq -一个R包,用于调整基于RNAseq数据的差异基因表达研究中的隐藏因素

Bioconductor版本:3.4

该软件包包含用于从RNAseq数据中识别两组样本之间差异表达基因的功能,调整了各种隐藏的生物和技术变异因素。

作者:Sutirtha Chakraborty

维护者:Sutirtha Chakraborty

引文(从R内,输入引用(“SVAPLSseq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SVAPLSseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SVAPLSseq”)

PDF R脚本 SVAPLSseq教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BatchEffectGeneExpression归一化RNASeq软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3)
进口 方法、统计数据SummarizedExperiment刨边机ggplot2limma航空航天平行,
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SVAPLSseq_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 SVAPLSseq_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) SVAPLSseq_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SVAPLSseq/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SVAPLSseq/
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文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网