要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“STRINGdb”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见STRINGdb.
Bioconductor版本:3.4
STRINGdb包提供了一个到STRING蛋白质相互作用数据库(http://www.string-db.org)的R接口。
作者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb- sibling .ch>
维护者:Alexander Roth < Alexander。罗斯在isb- sibling .ch>
引文(从R内,输入引用(“STRINGdb”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“STRINGdb”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“STRINGdb”)
R脚本 | STRINGdb装饰图案 | |
参考手册 |
biocViews | 网络,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(3.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.14.0) |
进口 | png,sqldf,plyr,igraph,RCurl、方法、RColorBrewer,gplots,哈希,plotrix |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | scsR |
进口我 | pwOmics |
建议我 | PCAN |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | STRINGdb_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | STRINGdb_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | STRINGdb_1.14.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/STRINGdb/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/STRINGdb/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |