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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SRGnet。

SRGnet R包研究协同响应基因的转录组数据

Bioconductor版本:3.4

我们开发了SRMnet分析协同监管机制在细胞转录组的概要文件,采取行动提高整体反应突变、药物或环境暴露。这个包可以用来识别管理模块协同响应基因的下游,优先考虑协同监管基因可能是潜在的干预目标,一些基因扰动实验。

作者:Isar Nassiri (aut (cre),马修·考尔(aut (cre)

维护人员:Isar Nassiri < isar_nassiri urmc.rochester.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SRGnet”)

文档

HTML		SRGnet: R包研究协同响应基因的转录组数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	回归,软件,StatisticalMethod
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.2.2)EBcoexpress,质量,igraph,pvclust(2.0 > = 0),红色的,粮食(> = 1.2 5),“绿带运动”(> = 2.1.1)limma,DMwR(> = 0.4.1),matrixStats
进口
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	SRGnet_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	SRGnet_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	SRGnet_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/srgnet/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SRGnet/
包下载报告	下载数据