要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SPIA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见SPIA。
Bioconductor版本:3.4
该软件包实现了信号通路影响分析(SPIA),该分析使用差异表达基因及其对数折叠变化以及信号通路拓扑结构的信息,以确定与研究条件最相关的通路。
作者:Adi Laurentiu Tarca
维护者:Adi Laurentiu Tarca
引文(从R内,输入引用(“SPIA”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SPIA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SPIA”)
R脚本 | SPIA | |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | GraphAndNetwork,微阵列,软件 |
版本 | 2.26.0 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(8年) |
许可证 | 文件许可 |
取决于 | R(>= 2.14.0),图形,KEGGgraph |
进口 | 图形 |
链接 | |
建议 | 图,Rgraphviz,hgu133plus2.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1 |
全靠我 | |
进口我 | EnrichmentBrowser |
建议我 | 石墨,KEGGgraph |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SPIA_2.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | SPIA_2.26.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | SPIA_2.26.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/SPIA/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SPIA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |