要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("SNPchip")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPchip.
Bioconductor版本:3.4
SNP阵列数据绘制函数;因历史原因而保留
作者:Robert Scharpf
维护者:Robert Scharpf
引用(从R中,输入引用(“SNPchip”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("SNPchip")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“SNPchip”)
R脚本 | 绘制染色体组型 | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
版本 | 2.20.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.0 (R-2.5)(10年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.14.0) |
进口 | 方法、图形晶格、网格foreach跑龙套,Biobase,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,SummarizedExperiment,oligoClasses(> = 1.31.1) |
链接 | |
建议 | crlmm(> = 1.17.14),RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | doSNOW,VanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer |
URL | http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html |
全靠我 | mBPCR |
进口我 | crlmm,phenoTest |
建议我 | 类别,MinimumDistance,oligoClasses,VanillaICE |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | SNPchip_2.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | SNPchip_2.20.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛队) | SNPchip_2.20.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/SNPchip/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |