要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("SNPchip")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SNPchip

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPchip

拷贝号更改的可视化

Bioconductor版本:3.4

SNP阵列数据绘制函数;因历史原因而保留

作者:Robert Scharpf 和Ingo Ruczinski

维护者:Robert Scharpf

引用(从R中,输入引用(“SNPchip”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("SNPchip")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“SNPchip”)

PDF R脚本 绘制染色体组型
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariationGeneticVariability单核苷酸多态性软件可视化
版本 2.20.0
在Bioconductor公司 BioC 2.0 (R-2.5)(10年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.14.0)
进口 方法、图形晶格、网格foreach跑龙套,BiobaseS4Vectors(> = 0.9.25),IRangesGenomeInfoDbGenomicRangesSummarizedExperimentoligoClasses(> = 1.31.1)
链接
建议 crlmm(> = 1.17.14),RUnit
SystemRequirements
增强了 doSNOWVanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer
URL http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html
全靠我 mBPCR
进口我 crlmmphenoTest
建议我 类别MinimumDistanceoligoClassesVanillaICE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 SNPchip_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 SNPchip_2.20.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) SNPchip_2.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SNPchip/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网