要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Rqc”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见Rqc。
Bioconductor版本:3.4
Rqc是一种优化的工具,设计用于高通量测序数据的质量控制和评估。它对整个文件执行并行处理,并生成包含一组高分辨率图形的报告。
作者:Welliton Souza, beniltoncarvalho
维护者:Welliton Souza
引文(从R中输入引用(“Rqc”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Rqc”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用Rqc |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,质量控制,测序,软件 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | BiocParallel,ShortRead,ggplot2 |
进口 | BiocGenerics,Biostrings,IRanges、方法、S4Vectors,knitr(> = 1.7),BiocStyle,plyr,减价、网格reshape2,消化,Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase,闪亮的,Rsamtools,GenomicAlignments,GenomicFiles |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/labbcb/Rqc |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | Rqc_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | Rqc_1.8.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | Rqc_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/Rqc/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rqc/ |
包下载报告 | 下载数据 |