要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Rqc”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

Rqc

此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本,请参见Rqc

高通量测序数据的质量控制工具

Bioconductor版本:3.4

Rqc是一种优化的工具,设计用于高通量测序数据的质量控制和评估。它对整个文件执行并行处理,并生成包含一组高分辨率图形的报告。

作者:Welliton Souza, beniltoncarvalho

维护者:Welliton Souza

引文(从R中输入引用(“Rqc”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Rqc”)

文档

超文本标记语言 R脚本 使用Rqc
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,质量控制,测序,软件
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 BiocParallel,ShortRead,ggplot2
进口 BiocGenerics,Biostrings,IRanges、方法、S4Vectors,knitr(> = 1.7),BiocStyle,plyr,减价、网格reshape2,消化,Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase,闪亮的,Rsamtools,GenomicAlignments,GenomicFiles
链接 Rcpp
建议 testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/labbcb/Rqc
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 Rqc_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 Rqc_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) Rqc_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/Rqc/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Rqc/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题张贴到以下地点之一:

  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网