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角色威力

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使用来自单个样本的配对表达数据推断miRNA-mRNA相互作用

Bioconductor版本:3.4

使用来自单个样本的配对表达数据的miRNA-mRNA交互签名(承诺)的推断概率。角色操作通过推断mRNA(miRNA)是miRNA(mRNA)的靶标的概率(miRNA)的概率,考虑到所有MRNA(miRNA)的表达,因为它们对同一miRNA的潜在竞争来说(mRNA)。由于细胞中的动态miRNA抑制,角色窗口假定总转录的mRNA水平高于观察到的(平衡)mRNA水平,并且迭代地根据上述推断更新每个mRNA靶标的总转录。NB:在论文中,我们将承诺用作型号名称和推断得分名称。

作者:岳丽

维护者:yue li

引文(从R内,输入引文(“角色威奇”)):

安装

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PDF. r script. 角色威力
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文本 消息

细节

Biocviews. 软件miRNA.
版本 1.12.0
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(3.5岁)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 2.10),Pracma.重塑Plotrix.microRNA.生物雕生物仪器BioBase.DBI.
进口
链接到
建议 ggplot2.
系统要求
加强
URL. http://www.cs.utortono.ca/~yueli/roleswitch.html.
取决于我
进口我 米尔拉布
建议我
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包档案包

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包来源 roleswitch_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件 roleswitch_1.12.0.zip.
Mac OS x 10.9(mavericks) roleswitch_1.12.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/roleswitch/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/roleswitch/
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