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rnbeads

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅rnbeads

rnbeads

生物导体版本:3.4

RNBEADS促进了对基因组量表各种类型的DNA甲基化数据的全面分析。

作者:Yassen Assenov [AUT],Pavlo Lutsik [AUT],Fabian Mueller [AUT,CRE]

维护者:fabian Mueller

引用(从r内,输入引用(“ rnbeads”)):

安装

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文档

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browsevignettes(“ rnbeads”)

PDF R脚本 综合DNA甲基化分析与RNBEADS
PDF R脚本 rnbeads注释
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 批处理效应,,,,CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,DataImport,,,,差甲基化,,,,表观遗传学,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,两通道
版本 1.6.1
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(2年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.0.0),生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),基因组机,,,,大量的,,,,rcolorbrewer,,,,,,,,ff,,,,字段,,,,GGPLOT2(> = 0.9.2),GPLOTS,,,,栅格,,,,林玛,,,,矩阵, 方法,Illuminaio,,,,甲基菌,,,,plyr
进口 iranges
链接
建议 类别,,,,地球,,,,gostats,,,,GVIZ,,,,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,,,,rpmm,,,,Reffreeewas,,,,rnbeads.hg19,,,,XML,,,,注释,,,,Biomart,,,,foreach,,,,多帕尔,,,,GGBIO,,,,ISVA,,,,mclust,,,,MGCV,,,,Minfi,,,,nlme,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,Quadprog,,,,rtracklayer,,,,SVA,,,,西瓜,,,,WordCloud,,,,argparse,,,,Glmnet,,,,
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 rnbeads.hg19,,,,rnbeads.hg38,,,,rnbeads.mm10,,,,rnbeads.mm9,,,,rnbeads.rn5
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 rnbeads_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 rnbeads_1.6.1.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) rnbeads_1.6.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/rnbeads/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rnbeads/
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