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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见林格．

芯片-芯片寡聚阵列的研究

Bioconductor版本:3.4

软件包Ringo有助于对ChIP-chip数据进行初步分析。该软件包的主要功能是数据读取，质量评估，数据可视化和识别显示富集在ChIP-chip的基因组区域。该包具有处理用于ChIP-chip项目的NimbleGen的双色寡核苷酸微阵列的功能，但也包含更多用于ChIP-chip数据分析的通用函数，因为数据是作为RGList(原始)或ExpressionSet(预处理)提供的。该包采用了来自Bioconductor项目的各种其他包的功能，并提供了额外的特定于chip- chip和特定于nimblegen的功能。

作者:Joern Toedling, Oleg Sklyar, Tammo Krueger, Matt Ritchie, Wolfgang Huber

维护者:J. Toedling

安装

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文档

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PDF	R脚本	R NimbleGen寡聚阵列的研究
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.38.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,Biobase(> = 1.14.1),RColorBrewer，limma，矩阵、网格晶格
进口	BiocGenerics(> = 0.1.11),genefilter，limma，vsn, stats4
链接
建议	rtracklayer(> = 1.3.1),mclust，topGO(> = 1.15.0)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	ccTutorial，SimBindProfiles，斯塔尔
进口我	Repitools
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	Ringo_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	Ringo_1.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	Ringo_1.38.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/Ringo/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Ringo/
软件包下载报告	下载数据