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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见Rcade．

基于r的ChIP-seq和差分表达式分析-一个集成基于计数的ChIP-seq分析与差分表达式汇总数据的工具

Bioconductor版本:3.4

Rcade(代表“基于r的ChIP-seq和差分表达式分析”)是一个通过贝叶斯框架集成ChIP-seq数据与差分表达式汇总数据的工具。一个关键的应用是识别感兴趣的转录因子靶向的基因——也就是说，我们收集与ChIP-seq峰值相关的基因，以及在与该TF相关的一些扰动下的差异表达。

作者:乔纳森·凯恩斯

维护者:Jonathan Cairns

安装

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文档

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PDF	R脚本	Rcade装饰图案
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialExpression，GeneExpression，遗传学，测序，软件，转录
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.14.0)，方法，GenomicRanges，Rsamtools，baySeq
进口	utils, grDevices，统计，图形，rgl，plotrix，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicAlignments
链接
建议	limma，biomaRt，RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	Rcade_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	Rcade_1.16.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	Rcade_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/Rcade/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rcade/
软件包下载报告	下载数据