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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RareVariantVis。

在全基因组测序数据可视化的罕见变异

Bioconductor版本:3.4

基因组变异可以使用许多分析和可视化工具。不幸的是,许多工具为全球审讯的变体是有限的。包RareVariantVis旨在提供基因组变异(尤其是罕见)在全球,每条染色体。可视化是表现在两个方面——标准输出png数据和交互,使用JavaScript d3包。交互式可视化允许分析三/家庭数据,例如在寻找致病变种罕见的孟德尔疾病。

作者:托马斯Stokowy

维护人员:托马斯Stokowy <托马斯。在k2.uib.no stokowy >

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PDF	R脚本	RareVariantVis
PDF		参考手册

细节

biocViews	GenomicVariation,测序,软件,WholeGenome
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	BiocGenerics,VariantAnnotation,googleVis
进口	S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges
链接
建议	knitr,AshkenazimSonChr21
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	RareVariantVis_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	RareVariantVis_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	RareVariantVis_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/rarevariantvis/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RareVariantVis/
包下载报告	下载数据