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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见RUVSeq．

从RNA-Seq数据中去除不需要的变化

Bioconductor版本:3.4

该包实现了Risso等人(2014)的去除不需要的变异(RUV)方法，用于样本之间RNA-Seq读取计数的规范化。

作者:Davide Risso [aut, cre, cph]， Sandrine Dudoit [aut]， Lorena Pantano [ctb]， Kamil Slowikowski [ctb]

维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RUVSeq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RUVSeq”)

PDF	R脚本	RUVSeq:从RNA-Seq数据中去除不需要的变异
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，预处理，RNASeq，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，EDASeq(> = 1.99.1),刨边机
进口	方法,质量
链接
建议	BiocStyle，knitr，RColorBrewer，zebrafishRNASeq，DESeq2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/drisso/RUVSeq
BugReports	https://github.com/drisso/RUVSeq/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	RUVSeq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	RUVSeq_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	RUVSeq_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/RUVSeq/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RUVSeq/
软件包下载报告	下载数据