要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rnaprobr”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

rnaprobr

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅rnaprobr

用于分析基于大规模平行测序的RNA结构探测数据的R包装

生物导体版本:3.4

该软件包促进了对下一代测序数据的分析,该数据的位置信息具有单个核苷酸分辨率是关键。它允许在表或UCSC兼容的床上图文件中应用不同类型的相关正常化,数据可视化和导出。

作者:Lukasz Jan Kielpinski [AUT],Nikos Sidiropoulos [Cre,Aut],Jeppe Vinther [aut]

维护者:nikos sidiropoulos

引用(从r内,输入引用(“ rnaprobr”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rnaprobr”)

PDF R脚本 RNAPROBR:用于分析基于大规模平行测序的RNA结构探测方法的R包装
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因数,,,,正常化,,,,测序,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.1.1),GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),生物基因(> = 0.10.0)
进口 生物弦(> = 2.32.1),基因组机(> = 1.16.4),rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),基因组签名(> = 1.5.12)
链接
建议 生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 rnaprobr_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 rnaprobr_1.6.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) rnaprobr_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/rnaprobr/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaprobr/
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