要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RDAVIDWebService”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见RDAVIDWebService.
Bioconductor版本:3.4
使用Web服务将数据从数据库中检索到R对象,用于注释、可视化和集成发现(DAVID)。该软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好连接,上传基因/背景列表,改变基因/背景位置,选择当前物种,选择注释等ii)提交的基因列表报告,注释类别摘要,基因/术语聚类,功能注释图,功能注释表
作者:克里斯托瓦尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯
维护者:Cristobal Fresno
引文(从R内,输入引用(“RDAVIDWebService”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RDAVIDWebService”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RDAVIDWebService”)
R脚本 | RDAVIDWebService: DAVID的多功能R接口 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GraphAndNetwork,软件,可视化 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(3.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 2.14.1),方法,图,GOstats,ggplot2 |
进口 | 类别,GO.db,RBGL,rJava |
链接 | |
建议 | Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/ |
全靠我 | CompGO |
进口我 | |
建议我 | FGNet |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RDAVIDWebService_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | RDAVIDWebService_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | RDAVIDWebService_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RDAVIDWebService/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RDAVIDWebService/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |