要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RDAVIDWebService”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RDAVIDWebService

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见RDAVIDWebService

一个R包,用于使用Web服务API从DAVID检索数据到R对象。

Bioconductor版本:3.4

使用Web服务将数据从数据库中检索到R对象,用于注释、可视化和集成发现(DAVID)。该软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好连接,上传基因/背景列表,改变基因/背景位置,选择当前物种,选择注释等ii)提交的基因列表报告,注释类别摘要,基因/术语聚类,功能注释图,功能注释表

作者:克里斯托瓦尔·弗雷斯诺和埃尔默·a·费尔南德斯

维护者:Cristobal Fresno

引文(从R内,输入引用(“RDAVIDWebService”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RDAVIDWebService”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RDAVIDWebService”)

PDF R脚本 RDAVIDWebService: DAVID的多功能R接口
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGraphAndNetwork软件可视化
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 2.14.1),方法,GOstatsggplot2
进口 类别GO.dbRBGLrJava
链接
建议 Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/
全靠我 CompGO
进口我
建议我 FGNet
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RDAVIDWebService_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 RDAVIDWebService_1.12.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) RDAVIDWebService_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RDAVIDWebService/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RDAVIDWebService/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网