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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“PanVizGenerator”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
PanVizGenerator
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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PanVizGenerator。
从你的pangenome生成PanViz可视化效果
Bioconductor版本:3.4
PanViz是一个基于JavaScript功能阳极注释pangenomes可视化工具。PanVizGenerator是PanViz的同伴,促进必要的数据预处理步骤中需要创建一个PanViz可视化工作。输出是完全自包含的可视化的收件人不需要R或PanVizGenerator安装。
作者:托马斯·彼得森林
维护人员:林托马斯·皮德森< thomasp85 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“PanVizGenerator”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“PanVizGenerator”)
文档
| HTML | R脚本 | 创建与PanVizGenerator PanViz可视化 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ComparativeGenomics,GUI,软件,可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(1年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | 方法 |
| 进口 | 闪亮的、工具、jsonlite,pcaMethods,FindMyFriends,igraph统计,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,消化 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator |
| BugReports | https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | PanVizGenerator_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PanVizGenerator_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.9(小牛) | PanVizGenerator_1.2.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/panvizgenerator/tree/release - 3.4 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PanVizGenerator/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
