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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见PWMEnrich．

PWM富集分析

Bioconductor版本:3.4

一个工具包的高级功能的DNA基序扫描和富集分析建立在Biostrings。主要功能是对已知PWM进行PWM富集分析(例如来自MotifDb等数据库)，但该包还实现了用于PWM扫描和可视化的高级功能。该包不执行“从头”motif发现，而是专注于使用由实验衍生或由其他工具计算构建的motif。

作者:Robert Stojnic, Diego Diez

维护者:Robert Stojnic < Robert。Stojnic在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“PWMEnrich”)

PDF	R脚本	“PWMEnrich”包概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MotifAnnotation，SequenceMatching，软件
版本	4.10.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	方法、网格BiocGenerics，Biostrings
进口	seqLogo，gdata，evd
链接
建议	MotifDb，BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3，PWMEnrich.Dmelanogaster.background，testthat，gtools平行,PWMEnrich.Hsapiens.background，PWMEnrich.Mmusculus.background，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	PWMEnrich.Dmelanogaster.background，PWMEnrich.Hsapiens.background，PWMEnrich.Mmusculus.background
进口我
建议我	rTRM
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	PWMEnrich_4.10.0.tar.gz
Windows二进制	PWMEnrich_4.10.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	PWMEnrich_4.10.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/PWMEnrich/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PWMEnrich/
软件包下载报告	下载数据