要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ asterismismdbi”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

有机体

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅有机体

软件可以使不同数据库软件包的平稳接口

生物导体版本:3.4

该软件包可以通过利用这些软件包实现选择方法的事实来实现一个简单的统一接口到几个具有自己的架构的注释软件包。

作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),赫尔夫(Herve)页,马丁·摩根(Martin Morgan),瓦莱丽·奥伯恩(Valerie Obenchain)

维护者:bioconductor.org>的Biocore数据团队<维护器>

引用(从r内,输入引用(“有机体”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ asterismismdbi”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“生物体”)

PDF R脚本 有机体:注释包的元框架
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.14.0),方法,生物基因(> = 0.15.10),AnnotationDbi(> = 1.33.15),GenomicFeatures(> = 1.23.31)
进口 生物酶,,,,Biocinstaller,,,,基因组机,,,,图形,,,,iranges,,,,rbgl,,,,rsqlite,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),统计
链接
建议 同性恋,,,,rattus.norvegicus,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,AnnotationHub,,,,fdb.ucsc.trnas,,,,rtracklayer,,,,Biomart,,,,运行
系统要求
增强
URL
取决于我 同性恋,,,,mus.musculus,,,,rattus.norvegicus
进口我 AnnotationHubdata,,,,epivizrdata,,,,GGBIO
建议我 Chippeakanno,,,,EPIVIZRSTANTALLONE
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Armisismdbi_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 有机体dbi_1.16.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) Armisismdbi_1.16.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/organismdbi/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/organismdbi/
软件包下载报告 下载统计

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生物导体

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
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