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此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本，请参阅moonlightr.。

鉴定来自常常数据的癌肠和肿瘤抑制基因

Bioconductor版本：3.4

动机：对癌症机制的理解需要鉴定在病理学发展中发挥作用的基因以及其作用的表征（特别是诱导癌症和肿瘤抑制）。结果：我们介绍了一个叫做Moonlightr的R / Biocumond封装，其基于TCGA表达数据返回特异性癌症类型的候选驾驶员基因列表。该方法首先Infers进行基因调节网络，然后进行功能性富集分析（FEA）（实施上游调节器分析，URA），以评分众所周知的生物过程对所研究的癌症类型的重要性。最终，通过随机森林，Moonlightr预测候选驾驶基因的两种特定作用：i）肿瘤抑制基因（TSG）和II）癌基因（OCGS）。因此，该方法不仅鉴定了在播放双重作用的基因（例如，在另一种癌症类型和OCG中的TSG），而且有助于阐明其特定作用的生物过程。特别是，Moonlightr可用于发现同一癌症类型中的OCG和TSG。这可能有助于回答问题的问题是否有些基因在乳腺癌中的早期阶段（I，II）和晚期阶段（III，IV）之间的作用。在未来，该分析可用于确定对化学治疗的不同电阻的原因。

作者：Antonio Colaprico *，Catharina Olsen *，Claudia Cava，Thilde Terkelsen，Laura Cantini，Andre Olsen，Gloria Bertoli，Andrei Zinovyev，Emmanuel Barillot，Isabella Castiglioni，Elena Papaleo，Gianluca Bontempi

维护者：Antonio Colapricro ，Catharina Olsen

安装

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细节

Biocviews.	德甲基化那不同的亚兴那差分甲基化那基因表达那GenereGulation.那GenesetenRichment.那甲基化阵列那网络那NetworkenRichment.那途径那软件那生存
版本	1.0.0
在生物导体中以来	BIOC 3.4（R-3.3）（0.5岁）
执照	GPL（> = 3）
依靠	r（> = 3.3），多达齐全那Foreach.
进口	Parmigene.那随机林那概括分析那贡献那盘旋那rcolorbrewer.那塞那ClusterProfiler.那剂量那BioBase.那林马，grdevices，图形，tcgabiolinks.那地理曲线，统计，Rismed.，网格，ilils
链接到
建议	生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那devtools.那Roxygen2.那PNG.
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URL.	https://github.com/torongs82/moonlight.
Bugreports.	https://github.com/torongs82/moonlight/issues.
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包来源	moonlightr_1.0.0.tar.gz.
Windows二进制文件	moonlightr_1.0.0.zip.
Mac OS x 10.9（mavericks）	moonlightr_1.0.0.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/moonlightr/tree/release-3.4
包短网址	http://biocidodder.org/packages/moonlightr/
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