要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见MinimumDistance.
Bioconductor版本:3.4
基于高维基因分型平台的三组从头拷贝数变异分析。
作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski
维护者:Robert B Scharpf
引文(从R内,输入引用(“MinimumDistance”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MinimumDistance”)
R脚本 | 检测病例-亲本三人组中从头拷贝数的改变 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,微阵列,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 2.10 (R-2.15)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3),VanillaICE(> = 1.31.3) |
进口 | 方法,BiocGenerics,Biobase,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.17.16),SummarizedExperiment(> = 0.2.0),oligoClasses,DNAcopy,ff,foreach,matrixStats,晶格,data.table,网格,统计,utils |
链接 | |
建议 | human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,SNPchip,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | 雪,doSNOW |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | MinimumDistance_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | MinimumDistance_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | MinimumDistance_1.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MinimumDistance/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |