要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

MinimumDistance

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见MinimumDistance

Case-Parent trio中De Novo CNV检测包

Bioconductor版本:3.4

基于高维基因分型平台的三组从头拷贝数变异分析。

作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护者:Robert B Scharpf

引文(从R内,输入引用(“MinimumDistance”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MinimumDistance”)

PDF R脚本 检测病例-亲本三人组中从头拷贝数的改变
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列单核苷酸多态性软件
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 2.10 (R-2.15)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3),VanillaICE(> = 1.31.3)
进口 方法,BiocGenericsBiobaseS4Vectors(> = 0.9.25),IRangesGenomeInfoDbGenomicRanges(> = 1.17.16),SummarizedExperiment(> = 0.2.0),oligoClassesDNAcopyffforeachmatrixStats晶格data.table,网格,统计,utils
链接
建议 human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19SNPchipRUnit
SystemRequirements
增强了 doSNOW
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MinimumDistance_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 MinimumDistance_1.18.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) MinimumDistance_1.18.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MinimumDistance/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网