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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅甲基粘合。

甲基粘合：识别甲基化驱动的癌症基因

生物导体版本：3.4

甲基粘合症是一种实施的算法，以鉴定疾病的超甲基化基因和低甲基化基因。甲基粘合基于β混合模型，以鉴定甲基化状态并将其与正常的DNA甲基化状态进行比较。甲基粘合使用新型统计量，差甲基化值或DM值定义为具有正常甲基化态的甲基化状态的差异。最后，匹配的基因表达数据用于通过关注影响基因表达的甲基化变化来识别功能性甲基化状态。参考文献：Gevaert 0.甲基粘合症：用于鉴定DNA甲基化驱动基因的R包装。生物信息学（英格兰牛津）。2015; 31（11）：1839-41。doi：10.1093/bioinformatics/btv020。Gevaert O，Tibshirani R，胸膜炎。使用甲基化的DNA甲基化驱动基因的Pancancer分析。 Genome Biology. 2015;16(1):17. doi:10.1186/s13059-014-0579-8.

作者：Olivier Gevaert

维护者：gmail.com上的Olivier Gevaert

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

html	R脚本	甲基粘合
PDF		参考手册

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，甲基化array，，，，网络，，，，途径，，，，软件，，，，统计信息
版本	2.0.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（2。5年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.2.0）
进口	foreach，，，，rpmm，，，，rcolorbrewer，，，，GGPLOT2，，，，rcurl，，，，算，，，，Data.Table，，，，林玛，，，，r.matlab，，，，消化
链接
建议	生物使用，，，，多帕尔，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

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包源	甲基mix_2.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	甲基mix_2.0.0.0.zip
Mac OS X 10.9（Mavericks）	甲基mix_2.0.0.0.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/methylmix/tree/release-3.4
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylmix/
软件包下载报告	下载统计