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这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MethylAid。

视觉和互动质量控制的大型Illumina公司DNA甲基化数组的数据集

Bioconductor版本:3.4

视觉和交互的web应用程序使用RStudio闪亮的包。坏质量检测到样品使用的数组和sample-independent控制出现在和用户可调阈值。深入探索坏质量的样品可以使用几个交互式诊断块执行质量控制探测器出现在数组中。此外,任何用户提供的批处理效应的影响可以探索。

作者:范Iterson (aut (cre)·托比[所有],罗德里克Slieker[所有],Wouter窝霍兰德[所有],Rene Luijk[所有]和Bas他(施)

维修工:m . van Iterson < mviterson gmail.com >

安装

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文档

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browseVignettes (“MethylAid”)

PDF	R脚本	MethylAid:视觉和互动质量控制Illumina公司人类DNA甲基化的数组数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	BatchEffect,DNAMethylation,GUI,MethylationArray,微阵列,质量控制,软件,TwoChannel,可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0)
进口	Biobase,BiocParallel,BiocGenerics,ggplot2、网格gridBasegrDevices图形,hexbin,matrixStats,minfi(> = 1.17.9)、方法RColorBrewer,闪亮的统计,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,MethylAidData,minfiData,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/mvaniterson/methylaid
BugReports	https://github.com/mvaniterson/methylaid/issues
取决于我	MethylAidData
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	MethylAid_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	MethylAid_1.8.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	MethylAid_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/methylaid/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MethylAid/
包下载报告	下载数据