##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MethPed”)

此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见MethPed。

用于鉴定小儿脑肿瘤亚型的DNA甲基化分类器工具

Bioconductor版本:3.4

将儿童肿瘤分类为生物学上定义的亚型是具有挑战性的，需要多方面的方法。为此，我们开发了一个基于DNA甲基化谱的诊断分类器。我们提供了MethPed作为一个易于使用的工具箱，允许研究人员和临床诊断人员测试单个样本和大队列儿童脑肿瘤的亚类预测。当前版本的MethPed可将肿瘤诊断/亚组分为:弥散性内因性脑桥胶质瘤(DIPG)、室管膜瘤(室管膜瘤)、伴有多层花结的胚胎性肿瘤(ETMR)、胶质母细胞瘤(GBM)、髓母细胞瘤(MB) - 3组(MB_Gr3)、4组(MB_Gr3)、WNT组(MB_WNT)、SHH组(MB_SHH)和毛细胞星形细胞瘤(piloastroo)。

作者:Mohammad Tanvir Ahamed [aut, trl]， Anna Danielsson [aut]， Szilárd Nemes [aut, trl]， Helena Carén [aut, cre, cph]

维护人员:Helena Carén

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MethPed”)

文档

超文本标记语言	R脚本	MethPed用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,DNAMethylation,表观遗传学,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.0.0),Biobase
进口	randomForest， grDevices，图像，统计
链接
建议	BiocStyle,knitr,减价,嫁祸于
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	MethPed_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MethPed_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	MethPed_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/MethPed/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MethPed/
包下载报告	下载数据