安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MetaboSignal”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MetaboSignal。
Bioconductor版本:3.4
MetaboSignal是一个R包,允许合并、分析和定制KEGG代谢和信号通路。它是一种基于网络的方法来探测基因之间的拓扑关系(信号——或者enzymatic-genes)和代谢物,代表了一个强大的工具来调查代谢表型的遗传景观和监管网络。
作者:安德里亚Rodriguez-Martinez <安德里亚。rodriguez-martinez13 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala < r。在imperial.ac.uk ayala14 >,Joram M. Posma
维护人员:安德里亚Rodriguez-Martinez <安德里亚。rodriguez-martinez13 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala < r。在imperial.ac.uk ayala14 >
从内部引用(R,回车引用(“MetaboSignal”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MetaboSignal”)
HTML | R脚本 | MetaboSignal |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneSignaling,GeneTarget,GraphAndNetwork,KEGG,网络,通路,Reactome,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.3) |
进口 | KEGGgraph,mygene,hpar,org.Hs.eg.db,igraph,RCurl,biomaRt,KEGGREST,AnnotationDbi、统计数据、图形,跑龙套 |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,BiocStyle,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | MetaboSignal_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | MetaboSignal_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛) | MetaboSignal_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/metabosignal/tree/release - 3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MetaboSignal/ |
包下载报告 | 下载数据 |