要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MBttest”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

mbt

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见mbt

多重Beta t检验

Bioconductor版本:3.4

MBttest方法是由Baggerly等(2003)的beta t检验方法发展而来。与baySeq (Hard castle and Kelly 2010)、DESeq (Anders and Huber 2010)、精确检验(Robinson and Smyth 2007, 2008)和McCarthy et al(2012)的GLM相比,MBttest具有较高的工作效率,即具有高幂次、高FDR估计保守性和高稳定性。MBttest适用于小样本或少量复制库中的转录组数据、标记数据、SAGE数据(计数数据)。它可以用来识别基因,mRNA异构体或标签在两种条件下差异表达。

作者:谭元德

维护人员:Tan Yuan-De

引文(从R内,输入引用(mbt)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MBttest”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (mbt)

PDF R脚本 使用“MBttest”软件包分析RNA-Seq计数数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicing报道DifferentialExpressionDifferentialSplicingGeneExpressionMultipleComparison圣人测序软件转录
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3.0), stats,gplotsgtools,图形,基础,utils, grDevices
进口
链接
建议 BiocStyleBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MBttest_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 MBttest_1.2.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) MBttest_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MBttest/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MBttest/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网