要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ madseq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Madseq。
生物导体版本:3.4
MADSEQ软件包提供了一组层次的Bayeisan模型,用于检测镶嵌性非整倍性,非整倍性类型的推断以及样品中非整倍体细胞分数的定量。
作者:Yu Kong,Adam Auton,John Murray Greally
维护者:yu kong
引用(从r内,输入引用(“ madseq”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ madseq”)
html | R脚本 | R包Madseq |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,库务,,,,覆盖范围,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,变体挖出 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(0.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.3),rjags(> = 4-6) |
进口 | VGAM,,,,结尾,,,,BSGENOME,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,S4VECTORS, 方法,预处理,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,变体,,,,总结性特征,,,,GenomeInfodB,,,,rtracklayer,图形,统计,grdevices,utils,Zlibbioc |
链接 | |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/ykong2/madseq |
BugReports | https://github.com/ykong2/madseq/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | madseq_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | MADSEQ_1.0.0.ZIP |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | MADSEQ_1.0.0.TGZ |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/madseq/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/madseq/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |