要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ madseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Madseq

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Madseq

使用大量平行测序数据的镶嵌性非整倍性检测和定量

生物导体版本:3.4

MADSEQ软件包提供了一组层次的Bayeisan模型,用于检测镶嵌性非整倍性,非整倍性类型的推断以及样品中非整倍体细胞分数的定量。

作者:Yu Kong,Adam Auton,John Murray Greally

维护者:yu kong

引用(从r内,输入引用(“ madseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ madseq”)

文档

html R脚本 R包Madseq
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,库务,,,,覆盖范围,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,变体挖出
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(0.5岁)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.3),rjags(> = 4-6)
进口 VGAM,,,,结尾,,,,BSGENOME,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,S4VECTORS, 方法,预处理,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,变体,,,,总结性特征,,,,GenomeInfodB,,,,rtracklayer,图形,统计,grdevices,utils,Zlibbioc
链接
建议 尼特
系统要求
增强
URL https://github.com/ykong2/madseq
BugReports https://github.com/ykong2/madseq/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 madseq_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 MADSEQ_1.0.0.ZIP
Mac OS X 10.9(Mavericks) MADSEQ_1.0.0.TGZ
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/madseq/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/madseq/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网