要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGprofile”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见KEGGprofile.
Bioconductor版本:3.4
KEGGprofile是一个集成了KEGG路径图中的表达式配置文件和功能注释的注释和可视化工具。多类型、多组的表达数据可以在一个路径图中可视化。KEGGprofile有助于更详细地分析不同基因和样本的特定功能变化内在通路或时间相关性。
作者:赵世林,郭燕,于夏
维护者:赵世林<世林。赵在vanderbilt.edu>
引文(从R内,输入引用(“KEGGprofile”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGprofile”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“KEGGprofile”)
R脚本 | KEGGprofile:应用示例 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | KEGG,通路,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | AnnotationDbi,png,TeachingDemos,XML,KEGG.db,KEGGREST,biomaRt |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | FGNet |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | KEGGprofile_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | KEGGprofile_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | KEGGprofile_1.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/KEGGprofile/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGprofile/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |