# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“KEGGlincs”)

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅KEGGlincs。

想象中的所有边缘KEGG通路和覆盖距离数据(选项)

Bioconductor版本:3.4

看看是怎么回事的引擎盖下面KEGG通路通过显式地重建信息从KGML获得文件的路径映射。

作者:Shana白

维修工:Shana白< vandersm mail.uc.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“KEGGlincs”)

文档

HTML	R脚本	KEGGlincs工作流
HTML	R脚本	KEGGlincs工作流
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,DataRepresentation,GeneExpression,GraphAndNetwork,KEGG,网络,NetworkInference,通路,软件,ThirdPartyClient
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3),KOdata,hgu133a.db,org.Hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口	AnnotationDbi,KEGGgraph,igraph,plyr,gtools,httr,RJSONIO,KEGGREST、方法、图形数据,跑龙套
链接
建议	BiocInstaller(> = 1.20.3),knitr,rmarkdown,图
SystemRequirements	Cytoscape (> = 3.3.0), Java (> = 8)
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	KEGGlincs_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGlincs_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	KEGGlincs_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/kegglincs/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGlincs/
包下载报告	下载数据