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此包适用于Bioconductor的3.4版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见KEGGgraph。

KEGGgraph: R和Bioconductor中KEGG通路的图表方法

Bioconductor版本:3.4

KEGGGraph是KEGG路径和图形对象之间的接口，也是一组用于分析、解剖和可视化这些图形的工具集合。它将定期更新的KGML (KEGG XML)文件解析为图形模型，维护所有基本路径属性。该包提供了解析、图形操作、可视化等功能。

作者:张吉涛，保罗·香农

维护者:Jitao David Zhang

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGgraph”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGgraph”)

PDF	R脚本	KEGGgraph:应用实例
PDF	R脚本	KEGGgraph: KEGG路径图
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GraphAndNetwork,KEGG,通路,软件,可视化
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(8年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	方法,XML(2.3 > = 0),图
链接
建议	Rgraphviz,RBGL,RUnit,RColorBrewer,KEGG.db,org.Hs.eg.db,hgu133plus2.db,SPIA
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.nextbiomotif.com
取决于我	ROntoTools,SPIA
进口我	限幅器,DEGraph,EnrichmentBrowser,KEGGlincs,MetaboSignal,NCIgraph,pathview,ToPASeq
建议我	DEGraph,GenomicRanges
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	KEGGgraph_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGgraph_1.32.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	KEGGgraph_1.32.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/KEGGgraph/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGgraph/
包下载报告	下载数据