要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Junctionseq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅JunctionSeq.。
Bioconductor版本:3.4
用于检测和可视化RNA-SEQ数据中的差动外显子或剪接结用的实用性。
作者:Stephen Hartley [Aut,Cre](PHD),Simon Anders [CPH],Alejandro Reyes [CPH]
维护者:Stephen Hartley
引文(从R内,输入引文(“JunigtionSeq”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Junctionseq”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“JunctionSeq”)
PDF. | JunctionSeq Vignette. | |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | 不同的亚兴那rnaseq.那测序那软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.3(R-3.3)(1年) |
执照 | 文件许可证 |
依靠 | R(> = 3.2.2),方法,概括分析(> = 0.2.0) |
进口 | deseq2.(> = 1.10.0),Statmod.那HMISC.那Plotrix.那stringr.那BioBase.(> = 2.30.0),Locfit.那生物根系(> = 0.7.5),生物相投那Genefilter.那Geneplotter.那S4Vectors.那绞喉那Genomicranges. |
链接到 | |
建议 | 大量的那kn那JCTSeqdata.那生物焦 |
系统要求 | |
加强 | 开罗那椒盐粉 |
URL. | http://hartleys.github.io/junctionseq/index.html. |
Bugreports. | https://github.com/hartleys/junctionseq/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | JCTSeqdata. |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | JunctionSeq_1.4.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | JunctionSeq_1.4.0.zip. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | JunctionSeq_1.4.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocondudard-mirror/junctionsq/tree/release-3.4 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/junctionseq// |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |