要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Junctionseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

JunctionSeq.

此套餐适用于Biocumonds 3.4版;对于稳定的最新版本版本,请参阅JunctionSeq.

JunctionSeq:用于检测RNA-SEQ数据中的微分外显子和拼接结用的实用工具

Bioconductor版本:3.4

用于检测和可视化RNA-SEQ数据中的差动外显子或剪接结用的实用性。

作者:Stephen Hartley [Aut,Cre](PHD),Simon Anders [CPH],Alejandro Reyes [CPH]

维护者:Stephen Hartley

引文(从R内,输入引文(“JunigtionSeq”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Junctionseq”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“JunctionSeq”)

PDF. JunctionSeq Vignette.
PDF. 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

Biocviews. 不同的亚兴rnaseq.测序软件
版本 1.4.0
在生物导体中以来 BIOC 3.3(R-3.3)(1年)
执照 文件许可证
依靠 R(> = 3.2.2),方法,概括分析(> = 0.2.0)
进口 deseq2.(> = 1.10.0),Statmod.HMISC.Plotrix.stringr.BioBase.(> = 2.30.0),Locfit.生物根系(> = 0.7.5),生物相投Genefilter.Geneplotter.S4Vectors.绞喉Genomicranges.
链接到
建议 大量的knJCTSeqdata.生物焦
系统要求
加强 开罗椒盐粉
URL. http://hartleys.github.io/junctionseq/index.html.
Bugreports. https://github.com/hartleys/junctionseq/issues.
取决于我
进口我
建议我 JCTSeqdata.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 JunctionSeq_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件 JunctionSeq_1.4.0.zip.
Mac OS x 10.9(mavericks) JunctionSeq_1.4.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondudard-mirror/junctionsq/tree/release-3.4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/junctionseq//
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
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