# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“电离”)

这个包是3.4版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅电离。

牛津纳米孔的奴才数据质量评估工具

Bioconductor版本:3.4

电离为牛津纳米孔的质量评估提供了工具的奴才数据。它从一组fast5文件提取摘要统计信息并可以使用之前或之后调用。除了标准的总结read-types产生,它提供了一个想象的土地数量指标相对于实验运行时间或空间flowcell表面。

作者:迈克·史密斯(aut (cre)

维护人员:迈克史密斯< grimbough gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“电离”)

文档

HTML	R脚本	纳米孔数据质量评估工具
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,质量控制,测序,软件
版本	1.4.4
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(1.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.3)
进口	rhdf5,dplyr,magrittr,tidyr,data.table,ShortRead,Biostrings,ggplot2、方法、BiocGenerics,XVector统计,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,gridExtra,testthat,minionSummaryData
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	IONiseR_1.4.4.tar.gz
Windows二进制	IONiseR_1.4.4.zip
Mac OS X 10.9(小牛)	IONiseR_1.4.4.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/ioniser/tree/release - 3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IONiseR/
包下载报告	下载数据