要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ hitc”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

HITC

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅HITC

高通量染色体构象捕获分析

生物导体版本:3.4

开发了HITC软件包,以探索高通量“ C”数据,例如5C或HI-C。还提供了专用的R类以及质量控制,标准化,可视化和进一步分析的标准方法。

作者:尼古拉斯仆人

维护者:尼古拉斯仆人

引用(从r内,输入引用(“ HITC”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ hitc”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ HITC”)

PDF R脚本 HI-C数据分析使用HITC
PDF R脚本 HITC包装简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,高通量序列,,,,测序,,,,软件
版本 1.18.1
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.15.0),方法,iranges,,,,基因组机
进口 生物弦,图形,grdevices,rtracklayer,,,,rcolorbrewer,,,,矩阵, 平行,GenomeInfodB
链接
建议 生物使用,,,,Hicdatahumanimr90
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Hicdatahumanimr90
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 hitc_1.18.1.tar.gz
Windows二进制 hitc_1.18.1.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) hitc_1.18.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/hitc/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/hitc/
软件包下载报告 下载统计

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