要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTSFilter”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

HTSFilter

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见HTSFilter

筛选复制的高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:3.4

该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序,以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。

作者:Andrea Rau, Melina Gallopin, Gilles Celeux, Florence Jaffrezic

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在jouy.inra.fr>

引文(从R内,输入引用(“HTSFilter”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTSFilter”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HTSFilter”)

PDF R脚本 HTSFilter装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression归一化预处理RNASeq测序软件
版本 1.14.1
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.0)
进口 刨边机(> = 3.9.14),DESeq2(> = 1.10.1),DESeq(> = 1.22.1),BiocParallel(> = 3),Biobase, utils,统计,grDevices,图形,方法
链接
建议 EDASeq(> = 2.1.4),BiocStyletestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 HTSFilter_1.14.1.tar.gz
Windows二进制 HTSFilter_1.14.1.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) HTSFilter_1.14.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/HTSFilter/tree/release-3.4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网