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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本，请参见HMMcopy．

拷贝数预测与校正GC和HTS数据的映射偏差

Bioconductor版本:3.4

纠正了单个全基因组样本固定长度非重叠窗口中读数计数(即覆盖率)的GC和可映射性偏差，产生用于进一步分析的拷贝数的粗略估计。设计用于快速校正高覆盖率全基因组肿瘤和正常样本。

作者:Daniel Lai, Gavin Ha, Sohrab Shah

维护者:Daniel Lai <达赖在bccrc。ca>， Sohrab Shah

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HMMcopy”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HMMcopy”)

PDF	R脚本	HMMcopy
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，预处理，测序，软件，可视化
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)，IRanges(> = 1.4.16),geneplotter(> = 1.24.0)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	qsea
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	HMMcopy_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	HMMcopy_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	HMMcopy_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/HMMcopy/tree/release-3.4
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HMMcopy/
软件包下载报告	下载数据