要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ greylistchip”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Greylistchip

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Greylistchip

灰色列表 - 基于芯片输入的面具人工制品区域

生物导体版本:3.4

识别输入中具有高信号的芯片实验区域,这会导致峰值呼叫期间杂散的峰值。删除在峰值通话之前与这些区域保持一致的读取,以进行清洁芯片分析。

作者:Gord Brown > gdbzork>

维护者:Gordon Brown

引用(从r内,输入引用(“ Greylistchip”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ greylistchip”)

文档

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Browsevignettes(“ Greylistchip”)

PDF R脚本 从输入库生成灰色列表
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,差异词,,,,基因数,,,,预处理,,,,测序,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(2年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.1),方法,基因组机
进口 基因组签名,,,,BSGENOME,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,大量的, 平行,GenomeInfodB,,,,总结性特征
链接
建议 生物使用,,,,生物基因,,,,运行
系统要求
增强 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 GreylistChip_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 GreylistChip_1.6.0.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) GreylistChip_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/greylistchip/tree/release-3.4
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/greylistchip/
软件包下载报告 下载统计

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